Abstract
蛋白質區域序列結構關聯在結構與計算生物學上是一個很有趣的主題。蛋白質區域結構預測是從無到有 (ab initio) 結構預測中必要的一部份。大部分區域結構預測方法都預設蛋白質區域序列與結構之間是一個 N 對1 的對應關聯。然而，對資料庫的觀察以及某些實驗的結果暗示了蛋白質的區域序列有可能在不同的蛋白質環境中形成不同的構形 (conformations)。一段區域序列的結構有可能是與所處環境相關的；因此有可能用一個結構機率分佈來描述區域結構。蛋白質序列的區域結構側寫 (profile) 可以作為一個描述蛋白質區域序列結構關聯的新方法。一段區域序列並不是只有對應到一個單一結構，而是對應到一個（結構的）機率分佈。區域結構側寫的構形變異程度可以用資訊理論 (information theory) 來衡量。結構熵值 (structure entropy) 可以作為一段區域序列的結構保守程度的指標。結構熵值和蛋白質的熱穩定性有對應的關聯。結構熵值和蛋白質的溫度係數與氫原子代換速率的比較顯示結構熵值對蛋白質熱穩定性的貢獻可能來自於機動性 (flexibility) 的變化。區域結構側寫更進一步被應用到蛋白質的比較上。由於這樣的比較是基於結構資訊，因此相較於傳統序列比對方法而言，預期能看出更多結構上的關聯。