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具CSαβ motif之模型蛋白質對氨基酸取代之耐受性研究
Dissertation

具CSαβ motif之模型蛋白質對氨基酸取代之耐受性研究

Yang, Ying-Fang
Doctor of Philosophy (PHD), 國立清華大學, 生物資訊與結構生物研究所
2008

Abstract

植物防禦素 蛋白質工程 蛋白質鷹架 蛋白質結構穩定性 系統性丙氨酸置換 cysteine-stabilized alpha beta motif CSab motif plant defensin alanine scan structural stability enzyme inhibition protein scaffold protein engineering
蛋白質鷹架為一對氨基酸置換具有高耐受度的胜肽骨架,本研究針對具有cysteine-stabilized □□ motif(CS□□ motif)之蛋白質鷹架進行系統性的耐受度研究。具有此一結構的蛋白質族群,其氨基酸序列相似度低,但可摺疊成相似度極高的立體構造,一般認為適合應用於蛋白質工程改質研究。綠豆第一型防禦素為一具有CSab motif的蛋白質,本研究中應用此一蛋白質做為模型,探討CSab motif對於氨基酸置換之耐受性,利用系統性丙氨酸置換方法,搜索對CS□□ motif之結構穩定性及生化功能具有決定性影響的氨基酸位置。本研究以核苷酸聚合酶鏈鎖反應方法對模型蛋進行點突變,對各突變蛋白進行旋光光譜、內生性螢光光譜及化學變性之測量,以酵素抑制能力作為生化指標。結果顯示,雖然部份突變完全失去酵素抑制能力,但所有突變蛋白質的結構穩定性並未有顯著變化。本研究為第一個對CSab motif進行完整的丙氨酸置換研究,所得之結果對CSab motif之蛋白質工程研究具有高度的應用參考價值。

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