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台灣眼鏡蛇心臟毒蛋白(III)在穩定度及摺疊路徑之探討
Thesis

台灣眼鏡蛇心臟毒蛋白(III)在穩定度及摺疊路徑之探討

洪國維
Masters, 國立清華大學, 化學系
1999

Abstract

心臟毒蛋白(III) 鑄造小體 摺疊 開散 變性劑 零散線圈 台灣眼鏡蛇 神經毒蛋白 cardiotoxin III(CTX III) molten globule folding unfolding denaturant random coil naja naja atra cobrotoxin
一般而言,在自然條件之下的蛋白質,必須具有其特定的摺疊構形,才能夠發揮它的生化活性。然而當我們利用蛋白質工程的技術來合成所需要的蛋白質時,卻經常發現所合成出的蛋白質無法進行摺疊,或是摺疊後不具有生化活性。因此我們有必要對蛋白質的穩定度與摺疊路徑作更進一步的探討。在本論文中,首先藉著pH、溫度、變性劑等不同的方式來探測蛋白質cardiotoxin III(CTX III)的穩定度,並根據結果,找出最適合的蛋白質摺疊條件。接下來,利用“停止流”(stopped-flow)以及“抑制流”(quenched-flow)的技術來對CTX III的動力學過程進行偵測,結果顯示無論變性劑為urea或是GdnHCl,對CTX III蛋白分子而言,都有下列的現象:1.CTX III的二級結構皆在100 ms之內完成摺疊。2.CTX III的再摺疊過程都是先以type II β-turn的形成來進行。3.Triple strand的摺疊速率皆比double strand來得快。且整個摺疊過程符合“two-state”的模式。而在氫氘交換實驗與溫度梯度實驗所得的結果則顯示,triple strand的結構穩定度大於double strand。若與quenched-flow NMR的實驗結果進行比較,則會發現“穩定度較高的區域會先進行摺疊”的現象;這樣的結果與Woodward的假說“first-in last-out”是相符的。此外,我們亦研究TFE對CTX III的螺旋誘導效應,結果發現雖然CTX III是一個All β-sheet、沒有形成α-helix傾向的蛋白質,但是TFE和HFIP卻仍然具有誘導α-helix產生的能力;因此我們假設TFE對CTX III的“螺旋誘導性質”在低濃度時是特定的(specific),在高濃度時則是非特定(nonspecific)。

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