Abstract
人類基因體解碼之後，在整個生物學的研究上邁向了另一個完全不同的嶄新境界。跟隨而來的各種研究問題如 : 基因定序、DNA序列與功能分析及蛋白質三維結構建立等等問題，更說明了對於生物學上更深一層的各種研究才剛剛開始而已。近幾年來，所謂的“系統生物學”(Systems Biology)這樣一個新研究領域逐漸興起;有著異於以往由下而上的研究方式，系統生物學強調的是著重於生物體內酵素及蛋白質相互間作用的關係及生化反應運作的機制。而從這個問題被提出一直到現在，已經有數千篇的論文探討相關的內容。在那些論文當中，通常有著一標準的作法 : 第一步先將計算機領域中的一些模型及概念導入，並加以適當的修正;第二步則將上一步中定義好的模型拿來描述及模擬一些已知的生化反應路徑(Pathway)，並檢測其正確性;最後，再根據此一模型為未知的生化反應路徑加以預測。但是，這樣的一個方式並非是架構生化反應路徑的唯一途徑。