Abstract
我們所研究的蛋白稱為Trigger Factor (TF)，在多數細菌中具高度保留性。此蛋白大小為49 kDa，並可分成三個區段，N端的ribosome-binding domain (RBD)、C端的chaperone domain （CTD），及peptidyl-prolyl cis/trans isomerase domain （PPIase）。其在生物中主要扮演的角色為輔助新合成胺基酸序列摺疊成三級結構，或是控管細胞內蛋白質的品質。藉RBD domain結合核醣體於新合成胺基酸序列的通道出口，TF蛋白成為新生蛋白質第一個接觸的輔助摺疊蛋白，其形成似搖籃的口袋，在通道口等待幫助新合成胺基酸的摺疊 。除了TF蛋白，仍有其它下游輔助摺疊的蛋白，但它們與TF蛋白最大不同，在於TF蛋白利用改變本身結構即可幫助約65-80%的蛋白完成摺疊。最近研究中發現，TF蛋白在水溶液中具有三態平衡，可以1:1的比例與核糖體結合、自行形成二聚體及維持單體。另外，對於TF蛋白結構研究上，發現在不同狀態下的TF蛋白，如有結合或沒有結合核醣體的TF蛋白，疊合它們的結構，發現各domain之間具有約10度角的旋轉。所以這篇論文主要研究TF蛋白水溶液中的動態運動，觀察其在水溶液中如何形成二聚體，再進一步探討TF蛋白與新合成蛋白序列之間如何作用以幫助摺疊。我們主要是利用核磁共振（NMR）技術研究。然而，我們所研究的分子對NMR而言是屬於大分子量蛋白質，在一般的方法下，會得到解析度較低的光譜而難以分析，因此，我們希望發展出一套由NMR技術結合其他技術，如小角度散射（SAXS）、residual dipolar coupling (RDC)、paramagnetic relaxation enhancement（PRE）…等方法，發展一套觀察大分子蛋白質在水溶液中動態表現的新研究方法， 進而應用在其他蛋白質上，突破以往NMR技術只能研究小分子蛋白（? 30kDa）的限制。