Abstract
摘要 近年來，隨著電腦計算機的進步，生物的研究來到了嶄新的時代，將以往生物體內信號、基因、細胞以及蛋白質的單一分析，統整成較大組織的研究，系統生物學就此誕生，用大量的數學模型去描述生物體內信號、基因、細胞以及蛋白質的相互作用，進而了解整個生物體網路的運作。 本文有兩個研究的主題，第一個是在免疫系統中，T細胞的運作模式。探討T細胞的如何從親和力僅有10倍之差的自身蛋白以及外來蛋白中，達到比〖10〗^(-6)還要小的識別錯誤率，並運用一個較為靈活且具未來性的馬可夫鏈（Markov Chains）模型去描述此識別過程。第二個是研究生物體的轉錄網路（transcription network）中的三節點模體（network motif），並得知前饋迴路為一個網路模體。接著探討其擁有的功能、優勢，得知其能夠在生物體不斷演化的過程中，大量存留在生物體中原因。