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cDNA微陣列實驗的2^k因子設計
Thesis

cDNA微陣列實驗的2^k因子設計

陳道鵬
Masters, National Tsing Hua University
2003

Abstract

微陣列實驗設計D-最佳化2^k因子設計最佳設計有效設計 Microarrayexperimental designD-optimality2^k factorial designoptimal designefficient design
cDNA微陣列(cDNA Microarray)是近十年發展出來的生物技術,可以同時檢測上萬個基因的表現。cDNA微陣列實驗過程中很多環節都要用到統計方法,本論文主要是針對實驗設計的部分。微陣列實驗要如何執行,方能讓研究者在有限的資源下獲得最多資訊,是本論文的主要目標。本論文探討微陣列實驗設計的一因子設計與2^k因子設計(factorial designs),此處的2^k因子設計假設只有主效應與二階交互作用存在。我們使用log ratio model來描述微陣列實驗數據與各個因子的關係,並以線性模式最佳化理論的D-optimality性質來當作評斷設計好壞的準則。當種類來自一因子設計時,我們提供了一個快速的演算法(algorithm)去尋找S = kV的有效設計(efficient design),經過電腦驗證這個演算法找到的設計效率都不錯。當種類來自2k的因子設計時,我們找到了D-optimality的理論上界,該上界只跟因子個數k有關,並提供建構S = V有效設計的方法。

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