Abstract
cDNA微陣列系統(cDNA microarray)之應用,在近年來越來越受到重視,也使得其發展漸近成熟,並能廣泛應用於各個領域,其對於基因表現的檢測更具有快速分析、準確率高以及可同時檢測大量基因之優點。 cDNA微陣列實驗中,會產生數量龐大的數據,要能有效的對基因表現數據進行分析與推論,統計方法的運用是重要的關鍵。實驗前,如何設計有效率的實驗程序,以減少實驗之變異,以及實驗結束後,如何分析大量的實驗數據,得到基因間之變化及相互關係,都是重要的統計議題。 本論文將著重於cDNA微陣列系統之實驗設計部分,探討在可用之晶片數給定下,如何安排實驗,比較許多有興趣之實驗種類,並且當實驗無法在同一時間內完成,必須分成不同批次,該如何來分批執行,且於每一批中安排哪些種類之樣本在晶片上做比較,使得這些樣本在各個基因之表現,能以最精確的方式被比較出來,此為本文之主要工作。 本文方法是將cDNA微陣列實驗之反應值,利用log ratio model建模與分析,推測該如何安排實驗,會使得此模型得到最精確之參數估計,也就是可較精確地得到各種類基因表現之比較。內容主要分成兩部份,第一部分為:在 D-optimality判別準則下,找到一個D-optimality之理論上界,這個上界可用來作為一個標準,判斷ㄧ實驗設計是否為最佳設計或與最佳設計相差多遠。第二部份為:根據此準則,利用電腦搜尋出在某些實驗條件下,有效之實驗設計。