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分子分析一段Alcaligenes eutrophus 的插入序列,IsAE1.
Thesis

分子分析一段Alcaligenes eutrophus 的插入序列,IsAE1.

康世旭
Masters, National Tsing Hua University
1990

Abstract

開放譯讀區分子分析革蘭氏陰性兼性化學自螢性二氧化碳固定自螢性插入序列重複序列 (OPEN READING FRAME)(GRAM-HEGATIVE)(FACULATIVELY-CHEMOLITHOTROPH)(INSERTION SEQUENCE)(DIRECT REPEATS)
Alcaligenes eutrophus 是革蘭氏陰性(Gram-negative) 的兼性的化學自營性(facu-latively-chemolithotrophic) 桿菌,其最為人所注意的生理特性在於此細菌能夠氧化氫氣產生能量(Hox ),並利用此能量進行二氧化碳固定 (CO -fixation,cfx ),合成本身所需要的有機物以行自營性的生活。以 Tn5致使突變 (Tn5 mutagenesis)研究和氧化氫氣能力有關的基因時,發現有一段 1.3kb的 DNA片段會插入 A.eutrophus體內Hup 質體上的hox 基因,造成A.eutrophus 氧化氫氣能力的喪失,由遺傳上的證據指出這一段1.3kb DNA 片段可能是一段插入序列(insertion sequence),於此定名為IsAE1 。本研究的目的即在於分子層次上去分析IsAE1 ,當確定了IsAE1 的核酸序列後,由其構造特徵看起來,IsAE1 很像一典型的細菌插入序列。IsAE1 全長1313配對鹼基,在兩端可見由 43 個鹼基所組成的反向重複序列(inverted repeats) IsAE1在插入另一 DNA片段時,會於插入處造成 8個鹼基的複製,形成同向重複序列 (directrepeats) 。在IsAE1 中最長的開放譯讀區(open reading frame)可轉譯成408 個氨基酸所組成的蛋白質。在這一個譯讀區之前,有一類似啟始因子(promoter)的區域存在,推測這一個最長譯讀區所轉譯的蛋白質非常可能即是轉移酵素 (transposase)。除了早期實驗結果所觀察的, IsAE1會由染色體 (chromosome)DNA移入 Hup質體,在本實驗也發現 IsAE1可由染色體一位置移到另一位置,由本研究所得全部證據均支持先前的假設 IsAE1是一段插入序列。

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