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利用核磁共振光譜來決定蛇毒蛋白在水溶液中之三度空間結構
Thesis

利用核磁共振光譜來決定蛇毒蛋白在水溶液中之三度空間結構

黃忠智
Masters, National Tsing Hua University
1993

Abstract

水溶液結構 核磁共振光譜 蛇毒蛋白 NMR solution structures simulated annealing
蛋白分子在生物過程中具有許多重要功能,而其功能與結構又有密切之關連。為了解其功能與結構之互動關係,結構之尋求為首要的工作。以往X-ray為找尋生物巨分子結構的唯一工具,而在核磁共振成功的應用於找尋分子結構後,情況已有改觀。本論文即是以 NMR尋求蛇毒蛋白在水溶液中之三度空間結構:以此方法首先須進行樣品製備與 NMR光譜偵測,接著為其氫質子化學位移之判定;完成判定後則是限制條件找尋並以分子模擬運算計算結構本文分為五章:首章為簡介。第二章為核磁共振及分子動態模擬焠熄的原理,內容包含核磁共振基本原理、二維核核磁共振光譜及分子動態模擬焠熄。第三章為尋求蛋白分子三度空間結構的方法,說明如何以自旋系統確認、循序判定以及主鏈方向連結型態互相配合,來完成氫光譜判定。並由 NMR 光譜找出距離限制條件、雙面角限制條件以及氫鍵限制條件後,以 X-PLOR 之距離幾何運算、分子動態模擬焠熄以及結構精緻化來求得三度空間結構。Cardiotoxin Ⅲ(CTXⅢ ) 與cardiotoxin Ⅱ(CTX Ⅱ)為台灣眼鏡蛇蛇毒蛋白之心臟毒素於層析圖上之第二以及第三成份。心臟毒素作用於肌肉與神經細胞,造成細胞去極化現象;其作用是由於心臟毒素與細胞膜結合而造成細胞膜組織與功能的混亂。第四章以及第五章將探討CTX Ⅲ與CTX Ⅱ之三度空間結構。

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