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利用電腦模擬及顯微鏡技術研究蛇毒與聚胺基葡萄醣之間的作用模式
Thesis

利用電腦模擬及顯微鏡技術研究蛇毒與聚胺基葡萄醣之間的作用模式

張雲鵬
Masters, National Tsing Hua University
1997

Abstract

心臟蛇毒磷脂水解酵素肝素聚胺基葡萄糖電腦模擬台灣眼鏡蛇 CardiotoxinPhospholipaseGlycosaminoglycanHeparinChondroitinSimulation
心臟蛇毒是眼鏡蛇毒液中的主要成分之一,細胞膜已被證實是心臟蛇毒的作用目標,近幾年,聚胺基葡萄糖也被證實能很強地和心臟蛇毒結合,這個發現能夠解釋為何心臟蛇毒對於不同的細胞類型有不同的毒性。進一步的研究更發現,不同的心臟蛇毒對於不同的聚胺基葡萄糖有不同的結合能力,而且,某些眼鏡蛇毒液中的磷脂水解酵素A2對於聚胺基葡萄糖也有很強地結合能力。為什麼不同的心臟蛇毒對於不同的聚胺基葡萄糖會有不同的結合能力呢?為什麼磷脂水解酵素A2對於聚胺基葡萄糖也有很強地結合能力呢?這兩個問題則是這篇碩士論文所要嘗試去探討的主要問題。在這篇論文中,主要使用的方法為:( 1 ) 可見光及紫外光光譜測定;(2 ) 顯微鏡觀測和( 3 ) 電腦計算及模擬。 由觀測到的實驗數據和電腦計算及模擬的結果顯示:( 1 ) 靜電力為聚胺基葡萄糖與心臟蛇毒結合的主要作用力之一;( 2 ) 聚胺基葡萄糖可能會導致某些心臟蛇毒或磷脂水解酵素A2形成二聚體(Dimer) 或多聚體( Multimer);( 3 )心臟蛇毒與聚胺基葡萄糖結合的位置可能位於帶正電胺基酸13,19和37所形成的正電凹陷區,而胺基酸 6,17與第二環尖端的帶正電胺基酸( 位於胺基酸28及33之間) 則可能調控不同的心臟蛇毒與不同的聚胺基葡萄糖之間的結合強度;( 4 ) 磷脂水解酵素A2與聚胺基葡萄糖結合的主要位置可能位於C端α螺旋的正電區。

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