Abstract
黃熱病毒家族包含黃熱病毒(YFV)，登革熱病毒(DENV)，日本腦炎病毒 (JEV)，蜱媒腦炎病毒(TBEV)，西尼羅病毒(WNV)，都是非常重要的節肢動物傳 染病毒，黃熱病毒被視為造成人類致病率與死亡率的重要病原體。其中登革熱是 由登革熱病毒(DENV)所引起，藉由埃及斑紋以及白線斑蚊作為傳播媒介，依病 毒血清型不同可分為四型 : DENV-1, DENV-2, DENV-3, DENV-4。世界衛生組織 (The World Health Organization)估計每年約會出現五千萬到一億個登革熱(Dengue fever)感染病例，目前沒有特殊的藥物治療和疫苗可用。許多研究認為登革熱病 毒外層覆蓋的封套蛋白(Envelope protein)是一主要抗原，特別是封套蛋白中的第三 區域(domain III)，在病毒辨識宿主受體與發生細胞融合過程中扮演重要的角色。 因此，許多研究利用domainIII作為標的物進行藥物的開發。我們實驗室利用了 SELEX技術篩選找到能與DENV-2 ED3親和性鍵結的核酸適體(S15)，結構為鳥嘌 呤-四重摺疊結構(G-quadruplex structure)，並且，發現S15與domainIII鍵結的區域在 四種不同血清型登革熱病毒中，有著高度相似性。於此次研究中，我們設計了一 個衍生自S15的新適體(S15G3)，S15G3與S15同樣為鳥嘌呤-四重摺疊結構，也能親 和性鍵結DENV-2 ED3。接著，進而研究S15G3序列中的Terminal與loops分別對於 親和性鍵結的影響，目的是想盡可能縮短適體(aptamer)的序列長度，降低合成所 需成本。研究結果顯示，terminal會影響親合性鍵結，而loops則不會影響鍵結，所以，我們將S15G3序列中的loops都縮短為A(Adnine, 腺嘌呤)，命名為: S15G3L123A，此較短序列的適體除了能有利於結構的分析之外，也更具潛力成 為抑制登革熱病毒感染的有效藥物。