Abstract
在這篇論文中，我們提出了對Solexa資料處理的流程與一個重定序的演算法。根據Solexa機器的定序實驗原理，定序時會使用接頭(adaptor)序列，而當對核糖核酸(RNA)定序時，接頭序列會有很大的機會接在一個讀數(read)的末端，造成對該讀數的汙染。首先，這篇論文介紹了一種移除接頭序列的方法，並比較對移除的接頭序列有無容錯的去除情形。接下來，介紹這篇論文所提出的重定序演算法。最後，比較這個演算法中，兩種不同切割資料方法的差異並與其他現有的重定序工具作比較。另外，我們將雞胚胎的Solexa讀數與Rfam上的已知核糖核酸作比較，根據Rfam核糖核酸分類樹，統計其分類結果。