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玉米活化因子類似序列的純群化與序列分析
Thesis

玉米活化因子類似序列的純群化與序列分析

呂俊毅
Masters, National Tsing Hua University
1989

Abstract

玉米活化因子純群化活化因子類序列分析 (AC-ELEMENT)(CACLL)LLBP
活化因子(Ac element)是玉米中的一種跳動基因。至今為止,我們利用遺傳學的方法,發現在玉米的基因組中,活化因子的數目通常是很低的,可是相反的,利用分子生物學的技術,我們卻能在玉米基因組中找到許多與活化因子類似的序列。到底這些與活化因子類似的序列和真正具備功能的活化因子之間有什么差別呢?它們在演化上又有什麼樣的關係?在這篇報告中,我從玉米的基因庫裡挑選出一個純群化的活化因子類似序列(cACll) 利用各種分子生物分析,將此類似序列與活化因子作功能上和序列結構上的整體比較。在序列結構上,我發現cAcll 全長共6069bp,除了兩個部位之外,它和活化因子有 90%以上的相似性。cAcll 的兩端也是和Ac一樣被11bp的倒置重覆序列所包圍,除此之外,因為活化因子移位的結果才會產生的 8bp插入部位重覆序列,也存在cAcll 的兩邊。由此我推論cAcll 是由Ac退化突變的衍生物。在功能上,我利用 PCR來偵測跳動基因移位所留下的空位,結果發現cAcll 不但自己不能自發地移位,甚至連另一個具功能的Ac存在時,都不能激發cAcll 移位。最有可能導致cAcll 失去功能的原因有二:第一,cAcll 在玉米基因組中 DNA序列的嚴重甲基化;第二;cAcll 在11bp倒置重覆序列上的些許改變。我假設最初原本具備功能的活化因子在跳進基因組中嚴重甲基化的部位後,本身也失去自發移位的功能,進一步由於 DNA序列上的突變或甲基化程度的增加,終於導致cAcll 失去所有移位的能力。

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