Abstract
臺灣眼鏡蛇毒中包含有五種不同的心臟毒蛋白，分別命名為CTXI、II、 III、IV以及IV。針對這些心臟毒來進行分析，所有心臟毒之胺基酸順序 的相似性大約有90﹪。 近年來有很多種心臟毒的水溶液結構已經被解出 ，觀察這些已經被解出結構之心臟毒蛋白的水溶液結構， 我們發現這些 蛇毒蛋白主鏈的纏繞方式皆相同。基本上， 心臟毒蛋白的立體結構是以 二級結構中的b-板狀結構為骨架，包含有一個雙股 b-反平行板以及一個 三股b-板狀結構。有趣的是， 這一些心臟毒蛋白雖然有相近的胺基酸序 列以及相似的水溶液三維結構， 但是若將各個心臟毒蛋白來比較，則有 明顯不同的生化活性。 舉例來說：比較台灣眼鏡蛇毒分離出來的心臟毒 蛋白成分II以及 IV，這兩種心臟毒蛋白只有一個胺基酸殘基的差異(位在 N-terminal的胺基酸殘基)。但是，它們卻在membrane depolarization activity方面展現出不同的生化活性。 這些由蛇毒中分離出來之不同生 化活性的心臟毒蛋白，一般認為造成其生化活性之差異的主因是由於這些 心臟毒蛋白在三維結構上有些許的不同。 為了能夠更深入的探討造成這 些生化活性差異的主因，我們必須要先瞭解心臟毒蛋白的三維水溶液結構 以做進一步的研究分析。在本篇論文中， 主要是探討台灣眼鏡蛇毒心臟 毒蛋白IV的核磁共振結構。 在以LC進行台灣眼鏡蛇毒分離時，心臟毒蛋 白IV是第四個被分離出來的蛇毒蛋白，因此以心臟毒蛋白IV稱之。 心臟 毒蛋白IV與其他分離出來的心臟毒蛋白相似，它們都包含有六十個胺基酸 殘基、由八個Cystein胺基酸生成四個雙硫鍵。 在這裡，利用核磁共振技 術得到二維核磁共振光譜，如：NOESY、TOCSY以及 DQF-COSY光譜，經由 光譜資訊的解讀，再配合上電腦動態模擬焠熄(dynamical simulated annealing)的方法，我們可以解得心臟毒蛋白IV在水溶液當中的三維核磁 共振結構。 完成結構計算步驟後，選取重疊性較佳的核磁共振結構進行 結構分析。主鏈的RMSD值為0.066nm，所有非氫原子的RMSD值則為0.118nm 。若只針對二級結構區域的主鏈進行分析，則兩股以及三股板狀結構的 RMSD值分別為0.031及0.021nm。 由心臟毒蛋白IV的核磁共振結構可看出 分子中包含有兩個疏水性區域， 一個是在迴圈 I的尖端，包含Leu6至 Tyr11等六個胺基酸殘基 ﹔令一個疏水性區域則在三股板狀結構區，以 Tyr22以及51為主幹，四周包圍著Ile39、Val49以及 Met 24等疏水性胺基 酸殘基。所有的支鏈都朝向同一個方向。