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青將魚粒線體去氧核醣核酸控制區(D-loop)之研究
Thesis

青將魚粒線體去氧核醣核酸控制區(D-loop)之研究

林思民
Masters, 國立清華大學, 生命科學系
1994

Abstract

青將魚;粒線體核醣核酸;控制區 medaka(Oryzias latipes);mtDNA;D-loop
為瞭解青將魚臺灣雙連埤族群與日本族群間的基因差異,並解決分類定位 的相關問題,本實驗選擇青將魚粒線體DNA的控制區 (displacement loop,或簡稱D-loop)進行核酸定序及比對工作。利用已知脊椎動物粒線 體DNA排序的保守區段,在D-loop外圍的 Cytochrome b gene及12S rRNA gene上合成引子(primer),並利用雙去氧核醣核酸鏈停止法( dideoxynucleotide chain termination)加以定序。定序得到臺灣青將魚 族群D-loop附近序列約1400 base pairs,日本族群約1500 base pairs, 整段包含完整的D-loop和三個轉譯核醣核酸基因(tRNA-Thr、tRNA-Pro及 tRNA-Phe),以及部份的Cyto- chrome b gene及12S rRNA基因。在D-loop 前段並發現一段以11-bp反覆重複(tandem repeat)的保守序列,其重複次 數在單一個體內可由七次至十四次不等,而造成單一體內的粒線體基因多 形化現象。比對十七隻採自單一族群(宜蘭雙連埤)之臺灣青將魚及三隻日 本青將魚,可發現族群內的相似度為99%以上,族群間的相似度僅為 90.4%。這種族群間的差異程度在類似的族群研究裡,甚至以大過某些魚 類之種間差異,顯示臺灣和日本這兩族群間的遺傳差異已相當顯著。但是 由於兩者之間在外型上尚無法明確判別,且缺乏其他領域相關的研究報告 ,關於臺灣族群的分類定位尚須進行更多的實驗謹慎探討。

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