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利用微陣列生物晶片資料與生物資料庫建構動態網路關係之方法
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利用微陣列生物晶片資料與生物資料庫建構動態網路關係之方法

一民 朱, 高成炎, 一民 朱, 李盛安, 詹鎮熊 and 潘冠宇
01/02/2010

Abstract

一種利用微陣列生物晶片資料與生物資料庫建構動態網路關係之方法,包含:(a)提供一包括一實驗組及一對應參考組之微陣列數據;(b)判斷其中一筆實驗組數據與對應之參考組數據間之差異量是否落在一預定範圍之內,若否,將該筆實驗組數據與對應參考組數據視為具有明確差異;(c)將微陣列數據套入一生物網路資料庫;(d)自生物網路資料庫中選擇一組資料,以做為一網路關連圖中一組與該組資料對應之初始資料點;(e)自生物網路資料庫中搜尋出一組與該組初始資料點相連且在微陣列數據中顯示有明確差異之差異資料點;及(f)繪製該網路關連圖。 【創作特點】 因此,本發明之目的,即在提供一種利用微陣列生物晶片資料與生物資料庫建構動態網路關係之方法,用以結合微陣列的實驗資料與生物分子網路資料庫的技術,可自動篩選出基因有變化的生物分子,呈現基因表現的動態變化,藉以大幅降低分析的難度,並能依據不同的實驗條件提供生物分子網路的特徵圖形。;於是,本發明利用微陣列生物晶片資料與生物資料庫建構動態網路關係之方法包含以下步驟。首先,提供一包括一實驗組及一對應參考組之微陣列數據,其中該實驗組是在一特定實驗條件下所取得。接著,判斷其中一筆實驗組數據與對應之參考組數據間之差異量是否落在一上限差異門檻值及一下限差異門檻值之間,若是,則將該筆實驗組數據與對應參考組數據視為無變異,若否,將該筆實驗組數據與對應參考組數據視為具有明確差異。接著,將該微陣列數據套入一生物網路資料庫。接著,利用一預定方式,自該生物網路資料庫中選擇一組資料,以做為一網路關連圖中一組與該組資料對應之初始資料點。接著,自該生物網路資料庫中搜尋出一組與該組初始資料點相連且在該微陣列數據中顯示具有明確差異之差異資料點,其中該組差異資料點對應於該特定實驗條件。然後,根據該組初始資料點以及該組差異資料點,繪製該網路關連圖
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